复方血栓通的副作用常见的有以下几种：
第一、胃肠道的反应，很多患者在服用后会出现胃胀、胃痛、胃部不适，同时会有恶心、呕吐的症状，因此该药物建议饭后服用，这样以减少对胃的刺激；
第二、由于主要是活血化瘀的作用，因此可能会导致出血的症状，如牙出血、鼻子出血以及黑便等，因此该药的服用一定是在医嘱下进行；
第三、很多患者会出现神经系统的症状，因为该药大部分用于脑梗塞的恢复期，所以有些患者会出现头晕、头痛等不适的症状，特别是有些患者在脑梗塞用后可能会加重一些小的出血风险。
最后是药三分毒，所有的药物都还会出现过敏的反应，严重的会出现皮肤的荨麻疹以及玫瑰糠疹。
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