宫外孕的主要病因是输卵管炎症所造成，可分为输卵管黏膜炎和输卵管周围炎。其次是输卵管妊娠史或手术史，曾有输卵管妊娠史，不管是经过保守治疗后自然吸收，还是接受输卵管保守性手术，再次异位妊娠的概率达10%。输卵管绝育史及手术史者输卵管妊娠的发生率为10%-20%。另外是输卵管发育不良或功能异常，也会导致宫外孕，比如输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏、双输卵管、输卵管憩室、输卵管副伞等、均可以造成输卵管妊娠。其次还有避孕失败，包括宫内节育器、避孕失败、口服紧急避孕药避孕失败，发生异位妊娠的几率较大。
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