EB病毒感染最重要的治疗是抗病毒治疗，建议早期应用抗病毒药物，疗效会更好。首选的药物是更昔洛韦、阿昔洛韦，干扰素也是可以的，只需要选择一种就可以。另外对于轻型的患者也可以不做特殊的处理，因为EB病毒感染本身具有一定自限性，大多数患者预后比较好。对于小部分患者可能病情较重或者伴有严重的并发症，这样的患者在抗病毒治疗的基础上，还建议使用小剂量的激素改善毒血症状，必要时可以使用人免疫球蛋白对症处理。
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