胃镜和喉镜，必要时可以一天进行，但不能同时进行两项检查。两项检查并不相同，因为主要观察部位有差异，喉镜是在耳鼻喉科进行的内窥镜检查，主要观察口咽腔、喉部、声带等部位是否出现异常。胃镜主要在消化科、消化内镜科室进行，检查范围主要包括口咽部、食管、胃和十二指肠等。
在进行胃镜检查时，应先观察咽喉部是否出现异常，然后顺着梨状窝进入食管，从食管上段和中段，直到食管下段，进入贲门再到胃。胃的各部位也需进行全方位观察，观察胃后，通过幽门进入十二指肠，对十二指肠的球部和降部进行观察。
若患有疾病需进行相关检查，可以在喉镜后再进行胃镜，或胃镜后再进行喉镜，时间上存在先后顺序，但可在同一天内进行。胃镜检查或喉镜检查，都需借助相应器械，对某些部位进行观察。但该操作并不会对该部位造成损伤，因此两者都不会对人体带来不利影响。若疾病需两者都做，只需在顺序上存在先后之分。
