舒筋健腰丸是属于一种中成类药物，主要的副作用就是胃肠道的刺激。在很多病人当中，服用舒筋健腰丸后可能会出现胃肠道的不适、反酸、恶心等症状。所以一般建议是在饭后服用，这样可以减少药物的对胃肠道的刺激和不适的感觉。
如果以往有胃肠道的疾病，比如慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃出血，建议禁止服用舒筋健腰丸，因为有可能会引起胃溃疡或胃出血疾病的复发。对于舒筋健腰丸有过敏的患者，还可能会引起全身的皮肤药疹。
