肛门上方凹陷处应该是位于肛门与尾骨之间的部位，这个部位如果出现剧烈的疼痛，首先考虑为肛周脓肿。肛周脓肿大多是由于肛隐窝感染所导致的，肛周脓肿按脓肿位置的高低，分为低位脓肿和高位脓肿，低位的脓肿可以行一次性根治术，也可以一期先行脓肿切开，二期形成肛瘘后再行肛瘘手术。而高位的脓肿大多需要行挂线术，如果行一次性切开根治有可能会导致肛门失禁。另外还有可能是一种少见疾病，称之为藏毛窦，藏毛窦大多发生于青春期毛发比较旺盛的男性，藏毛窦出现急性感染会伴有剧烈的疼痛，需要行切开引流，二期再行藏毛窦切除术。
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