男性感染HPV病毒最常见的表现是出现生殖器的尖锐湿疣，初期表现往往是感染的潜伏期或者亚临床期，这时候出现细密的小颗粒，肉眼往往不易辨认，需要借助放大镜、醋酸白试验才能够观察到，组织学和细胞学检测可以有HPV的病理改变。
有些人可能只是产生红斑、红点，不引起任何表现或组织细胞学的异常，而通过分子生物学的方法核酸杂交等，可以在皮肤黏膜的细胞中检测出来。HPV病毒感染生殖器尖锐湿疣好发部位，主要是男性的外阴、阴茎、睾丸表面、尿道口、肛门周围以及肛管内，经过初期的症状以后，逐渐会产生典型表现，可以肉眼见到典型的皮损，形态为乳头瘤状、菜花样、颗粒状或者鸡冠状，数目越来越多，颗粒本身也会越来越大。
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