益生菌是消化科临床常用的一类药物，益生菌的作用机制主要是通过直接补充，或者是促进肠道内形成一种有利于正常肠道细菌生长的微环境，从而达到调整肠道菌群的目的。正常的肠道菌群具有重要的屏障作用，正常肠道菌群对于人体的免疫功能、生长发育以及营养，也具有非常重要的作用。
常用的肠道益生菌制剂包括双歧杆菌、乳杆菌、肠链球菌、地衣芽孢杆菌、枯草杆菌等等。临床常用于治疗抗生素相关腹泻，以及与肠道菌群失调相关的腹泻、便秘、消化不良等疾病。不同厂家生产的肠道益生菌制剂，用量、用法不尽相同，一般口服2-3次/日。
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