肺结核吃药期间是有可能复发的，主要可能与结核耐药菌形成有关系。这些患者可能本身有基础疾病，例如糖尿病、自身免疫性疾病或者正在服用激素、免疫抑制剂等。有可能会导致结核杆菌再次繁殖，又或者患者没有全层规律联合服用药物，擅自停药或者减药也有可能会导致结核的复发。也有极少部分患者因为自身体质比较差，自身免疫力下降，在服药过程中也有可能会导致结核复发。肺结核属于呼吸系统慢性消耗性疾病，必须早期发现联合用药，足疗程的使用药物治疗，才能有效的减少复发率。
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