如果两个月的宝宝反复发生肠道感染，需要明确感染的病因，如是细菌性肠炎还是病毒性肠炎，可以通过大便常规检查、大便培养等相关检查明确，必要时可以通过肠镜检查了解具体的肠道感染的情况，明确感染的病因后再选择针对性的药物进行治疗，避免滥用抗生素。同时在饮食上给予无乳糖奶粉或母乳继续喂养，并且配合口服益生菌，调节胃肠功能，给予补锌，促进肠道功能的恢复，提高自身免疫力。还要注意宝宝是否有脱水的临床症状，如果存在严重的感染和脱水的症状，必要时给予输液治疗。
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