睡眠型癫痫有良性，也有难治性。70%的睡眠性癫痫属于良性，通过积极的药物治疗、神经调控和手术的方法可以治愈。有30%的患者属于难治性癫痫，随着病情的进展，病因持续存在，会逐步恶化。
比较常见的有进行性肌痉挛综合征，或者先天性因素造成的一些难治性癫痫，都会逐步恶化。只能通过药物、神经调控、手术的方法来缓解症状，或者延缓病情的发展。
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