如果子宫内膜在病理状态下持续性较薄，可能影响妊娠。子宫内膜薄可由于结核杆菌感染，导致子宫内膜破坏，有时可因多次进行人工流产、诊断性刮宫、清宫手术，在这类手术创伤的情况下，对子宫内膜，尤其子宫内膜的基底层，会造成一定破坏。这时如果无足够的激素给予相应修复，短时间内可导致宫腔粘连。一旦形成宫腔粘连，可导致月经量明显减少，甚至子宫原因的闭经，以及不孕症。
因此，子宫内膜薄不仅影响月经，还可影响后续妊娠。但女性子宫内膜在月经的不同时间段有不同厚度。如生理状态下，月经刚干净，或即将干净时，为整个月经周期中子宫内膜最薄的阶段，这时仅有0.3-0.4cm，大多为正常，无需过于与担心，并非有疾病。
随着卵泡的生长发育，随着雌激素水平的分泌，子宫内膜受到雌激素影响，逐渐变厚，月经前达到子宫内膜最后阶段。这时的子宫内膜厚度通常达到1cm，甚至1.5cm。因此如果发现子宫内膜薄，无需过于担心，应根据每个女性不同的年龄，不同的月经时间段，以及平时的月经量等，进行综合分析。
