红霉素眼膏和红霉素软膏差异是比较大的，虽然有效成分都是红霉素，但剂型不同，制作工艺、有效浓度和用途都不一样。红霉素软膏的浓度大，规格为1%，红霉素眼膏的浓度为0.5%。因为软膏是用在皮肤上的，眼膏是用眼睛的，皮肤耐受性肯定比眼睛大。
由于眼睛黏膜娇嫩、结构复杂，眼膏的制作工艺精细，药物颗粒细腻，对眼睛黏膜没有刺激性，消毒灭菌比较严格。软膏与眼膏相比，制作工艺比较简单，药物颗粒也没有那么细腻，消毒灭菌也没有那么严格。如果用软膏代替眼膏使用，因为软膏浓度大，消毒灭菌不够严格，使用后容易对眼睛产生刺激性，甚至使眼病加重。因此，二者是不可以混用的。
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