有肾结石做体外冲击波碎石对肾脏有一定的影响，尤其是长期多次碎石或者高频率碎石，都可能会对肾脏产生一定的损伤，但是如果短期碎石或者间隔时间较长的碎石对肾脏影响不大。原则上对肾脏进行体外冲击波碎石时，间隔的频率至少要7-10天才能进行第2次的碎石，否则间隔时间过短可以造成肾脏损伤以后出现肾脏纤维化。原则上同一部位进行反复体外冲击波碎石不应超过4次，如果超过4次可以造成肾脏创伤，而造成肾脏局部形成纤维化，甚至严重时可以影响肾脏血管造成肾萎缩等风险。所以一般肾脏结石最大径小于2cm可选择体外冲击波碎石，如果最大径超过2cm一般都建议手术治疗，以免反复体外冲击波碎石对肾脏产生损伤。
