试管婴儿的一代和二代的质量，通常没有可比性，即在胚胎的质量上，只要是在胚胎实验室的胚胎专家选择后留下能够用到的胚胎，通常没有区别。
选择试管的一代和二代，通常与胚胎无关，而是因为不同的适应证，得到不同的不孕症因素，具体如下：
1、一代试管婴儿称为IVF，主要是针对男女双方精卵无法相遇，即可能出现输卵管梗阻，或者输卵管功能上存在问题，精子和卵子无法相遇的情况；
2、二代试管婴儿，主要是将一个精子抓到比发丝还细的针中，随后注射到卵母细胞中，让其被动完成受精过程。如果精卵能够相遇，但是两者不能结合，为精卵结合障碍，多见于男方的重度少弱畸形精子症。另外部分卵母细胞的透明带存在异常，也会造成这类情况，建议患者做二代试管婴儿。
在无法自然怀孕的情况下，需根据患者不孕症的不孕因素，选择做一代试管婴儿，还是做二代试管婴儿。如果试管婴儿已经形成胚胎，两者间并没有优劣的区别。
