孕酮低一般是由于黄体功能不全导致的。由于卵巢排卵之后，黄体分泌功能不足，从而导致孕激素分泌减少，使子宫内膜分泌转化不足，容易导致排卵性功血、受精卵不容易着床或者不孕、习惯性流产。导致黄体功能不全的原因有：垂体分泌黄体生成素、促卵泡成熟素不足，或者分泌催乳素过多等引起，临床主要表现在月经变得频发、不孕、流产，一般在排卵后可以通过查血孕激素来判断。治疗可以通过口服黄体酮胶囊或者注射黄体酮针剂，也可以注射绒毛膜促性腺激素，促进卵泡的生长发育治疗。
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