手足口病的相关化验单之中，能明确阴性或者阳性的检查项目，往往是相关的病原体。导致手足口病的病毒种类有很多，比较常见的是柯萨奇病毒A组16型以及肠道病毒71型。这两型病毒都能导致手足口病，但是重症的手足口病之中，肠道病毒71型的情况更多见。如果肠道病毒71型抗体是阴性的，手足口病出现重症的可能性就要稍微小一些。如果只能检查柯萨奇病毒A组16型，不能检查肠道病毒71型，这时柯萨奇病毒A组16型是阴性，而且患儿又比较重，就要怀疑是不是肠道病毒71型的感染，因为这一型病毒导致中枢神经系统并发症的可能性，比柯萨奇病毒A组16型大。
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