基础体温是当人体处于完全休息的状态，排除精神及一切客观因素干扰测出的体温，称为基础体温，一般以早晨六点钟醒来，没有起床活动时测得的体温最准确，基础体温可以较准确地反映卵巢的排卵功能和相应内分泌水平。排卵前称为卵泡期，卵巢分泌雌激素，基础体温大多是在36.6℃以下。排卵后卵巢内的黄体分泌孕激素，孕激素对中枢神经系统有制热、升温的作用，使基础体温升高0.3-0.5℃。体温的升高一直持续到月经来潮前1-2天开始下降。在有排卵的月经周期中，基础体温的变化呈现双向型的曲线。
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