松果体囊肿是在临床上，特别是在核磁共振检查的时候发现的一种病变，绝大多数的松果体囊肿本身并不引起明显的症状，所以临床上看到松果体囊肿选择是观察。如果过1-2年做两次核磁看松果体囊肿不增大，这种情况下就不用管，就是良性的病变。
个别松果体囊肿比较大，特别是松果体囊肿里面有实质性的成分，这个时候要考虑是不是松果体区的肿瘤，对松果体囊肿引起梗阻性脑积水，或者怀疑松果体区的肿瘤囊性变，这两种情况下需要采取显微神经外科手术的办法切除囊肿，恢复脑脊液的正常的循环。
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