正常的阴道内，虽然有多种微生物存在，但是这些微生物相互依赖，相互制约，能够达到动态的平衡，并不致病，主要起作用的是乳杆菌。如果阴道的微生态被打破，可以导致阴道感染，也就是阴道炎症。阴道的酸性环境被改变，如果频繁的性生活、阴道灌洗都可以改变阴道的酸性环境，不利于乳杆菌的生长。如果厌氧菌过度的生长，可以导致细菌性阴道病，长期的应用广谱抗生素，可以抑制乳杆菌的生长，若是真菌过度的增殖，可以导致外阴阴道的假丝酵母菌病。外源性的病原体侵入，比如滴虫进入阴道，可以导致滴虫性阴道炎。
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