如果新生儿有细菌感染或者支原体感染，衣原体感染的情况下，需要应用抗生素来抗感染治疗。如果孩子应用抗生素不得当，会有下面的影响。首先，孩子会有胃肠道的不舒服。如果孩子应用抗生素以后，常常会出现腹痛、腹泻、腹胀等，这都是胃肠道不舒服的症状表现。其次，会引起孩子继发性的真菌性肠炎。这种情况常见于孩子抗生素用的时间比较长，从而引起肠道菌群的紊乱，孩子会继发出现真菌性肠炎。要及时地给孩子抗真菌治疗，如给孩子应用大扶康等。然后，抗生素应用过多以后，孩子还会出现免疫功能的障碍。比如，孩子会出现免疫功能紊乱的哮喘发生，孩子会演变为过敏体质，从而出现湿疹、荨麻疹、支气管哮喘等。
