儿童在打了手足口病疫苗以后还是会得手足口病，儿童接种过疫苗以后还会出现手足口病的原因，主要是由于发病的病原菌不止一种引起的。目前手足口病疫苗主要是针对EV71肠道病毒的情况，手足口病的重症病例，绝大多数是由于儿童感染了EV71病毒造成的，但是造成手足口病的病毒不仅仅是EV71，儿童在患有柯萨奇病毒等肠道病毒以后也会引起手足口病，会出现手、足、口以及臀部的疱疹，这种情况非常常见，因为手足口病疫苗也不会引起交叉性的免疫，即接种了EV71的手足口病疫苗，对于预防柯萨奇病毒造成的手足口病没有效果。所以儿童在打了疫苗以后，还会患有手足口病。
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