替诺福韦的肾毒性要比恩替卡韦大，替诺福韦除了有肾毒性反应以外，在用药期间还会出现皮疹、过敏，神经系统症状，如头晕、头痛，胃肠道刺激症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等，代谢性症状，如低磷酸盐血症，可以导致骨质疏松、向心性肥胖、肢端末梢变瘦、乳房增大、肝肿大等，轻微的呼吸困难等症状，泌尿系统的症状，如肌酐升高等。
恩替卡韦一般没有肾毒性反应，但是恩替卡韦会出现头晕、头痛、嗜睡、乏力以及恶心、呕吐、腹痛、腹泻的副反应。恩替卡韦和替诺福韦都是可以抑制乙型肝炎病毒复制的药物，替诺福韦还可以抑制HIV病毒的复制。
