咳嗽本身是一种自身的保护性反射，会把呼吸道的分泌物清除出去。如果早上咳嗽，说明在夜间睡眠的过程中气道里分泌物增多，不能有效的排出，所以早上醒来的时候有咳嗽反射，把痰咳出来。
这种情况最常见于慢性支气管炎的患者，特别是长期吸烟的患者。吸烟患者的纤毛运动相对来说是受损的，清除气道分泌物的能力也是减弱的，早晨的时候会有这种咳嗽的情况。还有过敏因素引起来的晨起咳嗽，有的时候不是单纯的咳嗽，可能还伴有打喷嚏、流清水鼻涕的情况。还有鼻部或者鼻窦部有炎症，称为上气道炎症综合征，在平卧的时候可能会有鼻后滴流，引起咽部出现咳嗽反射，早晨的时候可能咳嗽增多。
