肝内胆管结石总疼需要行手术治疗。多数肝内胆管结石患者不会出现临床症状，但部分患者也可出现疼痛、发热等临床表现，或者患者在做CT或磁共振时，发现肝内胆管结石有可能导致肝脏恶变，建议进行手术治疗。
根据结石在肝内的部位不同，比如结石在左肝，则需把左半肝切除。如果结石在右肝，则要切除右边的部分肝脏。所以，肝胆管结石如果总疼，建议患者做肝脏切除。但肝切除的部位与手术方式的选择，要具体问题具体分析。
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