基底节区是大脑重要的功能性区域，它的供血主要是来自大脑中动脉的穿支小动脉，因此容易发生血栓或者出血事件。一旦发生血栓或出血的急性脑血管事件，病情往往较重。其原因主要是基底节区含有大量的神经纤维束，收集来自四肢、躯干、头颈部的运动和感觉纤维。因此基底节区的病变可以导致明显的神经功能障碍，导致肢体感觉、运动、语言、吞咽功能障碍，可以看到患者肢体瘫痪、口齿不清、失语、大小便障碍，以及饮水呛咳等严重的神经功能障碍。
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