艾滋病无论是初期、中期还是晚期，在现有的医疗条件下都是无法彻底治愈的。虽然目前有两例公认的被治愈的艾滋病病例，但所需条件极为苛刻，很难复制，所以无法推广。就目前来说，没有任何一种药物或方法能够保证彻底杀灭并清除艾滋病病毒，或让其永远处于休眠状态。至于将来会不会出现治愈的方法和药物，也还没有定论。
艾滋病不能治愈的主要原因是病毒感染人体后，其基因组与人体淋巴细胞核的基因组进行了整合。一部分细胞被激活后很容易被抗逆转录病毒药物清除，而另一部分细胞没有被激活就成为了病毒的储存库，不能被抗病毒药物清除。而细胞内的病毒可重新激活又出现病毒复制，所以导致病毒很难被彻底杀灭并清除。另外艾滋病病毒还具有极强的变异能力，很有可能会发生变异，导致耐药性的产生，使原本应用的抗病毒药物失效。
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