厌氧菌是一类在无氧条件下比在有氧环境中生存要好，不能在空气当中生存。这一类细菌缺乏完整的代谢酶体系，能量代谢以无氧发酵的方式进行。根据感染的不同部位，可以出现不同的疾病，包括阑尾炎、胆囊炎、中耳炎、口腔感染、心内膜炎、子宫内膜炎、脑脓肿、心肌坏死、骨髓炎、腹膜炎、脓胸、输卵管炎、脓毒性关节炎、肝脓肿、鼻窦炎、肠道手术或者创伤后的伤口感染、盆腔炎以及菌血症等。随着培养技术的不断改进，厌氧菌得以及时的分离和鉴定，厌氧菌感染的报道逐渐增多，厌氧菌也是可以彻底治疗的疾病，甲硝唑是常用的药物。
