胸部CT检查有时可以发生误诊或漏诊肺结核，虽然胸部CT可以见到肺结核特征性的改变，例如多发、多部位、多形态以及渗出、增生、坏死性病变等结核病灶存在，此时可以初步诊断为肺结核。但有时由细菌、病毒、霉菌等致病原感染引起的类似结核病灶，容易发生误诊。另外，某些非感性病变，例如肿瘤、结缔组织病亦可以导致上述病灶。故单凭胸部CT检查不能确诊肺结核，需要结合临床症状以及痰检找到结核杆菌来确诊。部分患者还需要对肺结核不典型的病灶进行病理活检，找到结核的坏死性肉芽肿时可以确诊为肺结核。
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