化脓性扁桃体炎的脓液中，主要细菌有链球菌、溶血性链球菌、葡萄球菌以及其他的细菌，总之咽扁还是蒲地兰，对这些细菌都没有直接的杀灭作用，所以正常的选用是抗生素。而抗生素一般是指青霉素类或者头孢类，对小孩没有明显肝和肾的毒副功能。在化脓性扁桃体炎的时候，疗程需要7天以上，而且脓液会在7天以后消失，但是7-14天是扁桃体黏膜的恢复时间。抗生素的使用应该在化脓性扁桃体炎症状消失、小孩没有发烧以后的3天才停药，因为怕化脓部位的细菌会潜伏在身体里面，以后引起肾炎或者关节炎，甚者是心脏炎，所以刚才提到的两种药都是辅助用药，而不是靶向治疗用药。
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