艾滋病最常见的机会性感染是肺孢子菌肺炎。一般患者的临床表现为咳嗽、胸闷等症状，有的会伴有发热，大多数患者咳嗽、咳痰症状并不是很明显，但胸闷症状会进行性加重，肺部CT为提示两肺间质性的改变。这样的患者需要及时的治疗，因为有出现呼吸衰竭而危及生命的风险。对于肺孢子菌肺炎的治疗，最重要的是进行病原菌的处理，一般首选的药物是SMZ。当然对于重症的患者建议联合棘白菌素类的药物进行处理。如果胸闷症状比较明显，也可以使用激素来对症处理。
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