生物酶制剂的用途比较广泛，主要用作医药的中间体，包括食品加工所用的添加剂，以及一部分家畜或者家禽在养殖过程中的生长促进剂。另外在其它一些领域，包括轻工业、皮革业、造纸业、军工业等行业当中都有广泛的应用。
生物酶制剂主要的种类包括蛋白酶、糖酶淀粉酶、纤维素酶、过氧化氢酶等，用量比较多的是淀粉酶和蛋白酶，可以占到生物酶制剂的70%-80%。其中的淀粉酶主要用于面包生产过程当中面团的改良，包括婴幼儿的食品中谷类原料的预处理，以及一部分的啤酒制造业中用于糖化和分解其中的淀粉。在果汁加工业中可以用作淀粉的分解或者提高过滤速度，还能用于一部分的蔬菜、饴糖、葡萄糖等食品的加工和制造的过程。
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