怀孕之后做亲子鉴定主要有两种方法：第一、抽母亲的血液进行检测，这种方法主要是抽母体的外周血，所以对母亲和胎儿都是没有什么影响的。要求患者怀孕两个月左右就可以进行监测，只是花费高。如果检测出来有问题，因为患者怀孕时间比较短，可以通过一般的人工流产手术结束妊娠，对患者的影响也是很小的。第二、如果患者选择的是通过绒毛或者穿刺进行鉴定，对胎儿就会造成一定的影响。因为如果操作不当，有可能会引起宫腔内的感染，而且也有可能会引发宫缩而导致流产。所以这种损伤相对比较大，建议患者选择第一种检测方法。
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