核磁共振没有任何的不良影响，由于价格比较昂贵，在妇产科不属于常规检查，只有在出现特殊情况时才需要做子宫核磁共振检查。如果女性是由于检宫腔内异常占位或者子宫上有异常包块，需要进一步做核磁共振检查，最佳时间在月经干净后一周内，因为没有月经血的排出，就不会影响核磁共振的检查结果，对于已经绝经的老年女性可以随时做核磁共振检查，没有特殊的时间要求。如果是怀孕中期的女性，四维彩超检查后发现胎儿颅内有异常回声，可以做核磁共振进行检查，但没有所谓的最佳时间，而是随时都可以检查。
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