精子形态的染色分析，多数采用改良巴氏染色法，这是《世界卫生组织人类精液检查与处理实验室手册》推荐的方法，使用方法比较简便，其他的方法还有HE染色、瑞氏染色法。精子形态的判定标准，通常是头、颈、中段、尾部都正常的精子才算正常。
精子的头必须是椭圆形，顶体界限清晰，占头部的40%-70%。中段细，大约为头部长度的1.5倍。胞浆小滴，应该小于正常头部大小的一半。尾部应该较直，比中段细，且均一、非卷曲，长度约为45μm。在评估精子正常形态时，应该使用这种严格的标准，利用这个标准，正常生育男性精液当中，正常形态的精子比例应该大于15%。
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