降低尿液中亚硝酸盐表达最直接的方式是抗生素治疗。在尿液当中，如果出现亚硝酸盐阳性，临床意义主要是怀疑有尿路感染，因为在尿液中的一些细菌，比如大肠埃希菌、克雷伯杆菌、变形杆菌以及假单胞菌，可以将尿液中的硝酸盐转化为亚硝酸盐，因此亚硝酸盐是尿路感染的指标。在这个过程当中，首先尿液中需要有硝酸盐，其次是尿液中的细菌要达到一定的数量，超过10^5个/ml，同时二者的作用时间要超过4个小时，才会造成尿液中亚硝酸盐表达阳性。
鉴于尿液中亚硝酸盐的表达是尿路感染结果，因此在治疗中最主要的手段是应用抗生素，必要时可以根据尿培养的结果，选择敏感抗生素进行治疗。对于尿路感染，下尿路感染治疗通常比较简单，用短程疗法可以控制住感染，而对于上尿路感染，可能使用抗生素的时间要长一些。
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