菌痢也就是细菌性痢疾，是由痢疾杆菌引起的一种肠道传染病。
针对菌痢的病原学治疗就是应用抗生素，抗生素的选择应该根据药敏试验和粪便培养的结果进行，在没有拿到结果之前，常用的药物包括几种：
1、喹诺酮类的药物，具有抗菌谱广、口服吸收好、不良反应小、耐药菌株相对比较少的特点，可以作为首选药物，首选环丙沙星、左氧氟沙星等。
2、头孢类的头孢噻肟及头孢曲松也可以应用。
3、小檗碱，也就是黄连素，因为具有减少肠道分泌的作用，所以在使用抗生素的时候可以同时使用。
除了抗生素治疗之外，患者要隔离，注意休息，注意饮食，如果出现脱水、高热、症状明显、腹痛剧烈的患者要对症处理。
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