脑核磁跟脑CT有区别，脑CT对于急性卒中患者是最常用的检查，对发病早期脑梗死与脑出血的识别非常重要，脑CT对急性期的小梗死灶不敏感，特别是脑干和小脑的小梗死灶更难检出。磁共振在发病数小时后就可显示出病变区域的检查，与CT相比，脑核磁可以发现脑干、小脑及小灶性梗死，功能性磁共振如弥散加权成像和灌注加权成像，可以在发病后的数分钟内检测到缺血性的改变，早期梗死磁共振诊断的敏感性可达到88%-100%。
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