栓塞是指血栓栓子脱落到远端造成远端局部缺血坏死。心源性栓塞即栓子主要来源于心脏，其中房颤是最主要病因。房颤一旦发生，因心房本身失去收缩舒张功能会产生湍流，此时有可能形成局部血栓。血栓一旦形成以后在某些特定情况下随着血液流动，冲刷流动到大脑会引起大脑组织闭塞，即脑卒中。
对于房颤患者来说，脑卒中发生几率有可能比正常人高4-5倍，若患者合并糖尿病或高血压基础疾病，发病率有可能会持续更高。对于房颤患者，为预防脑卒中发生，建议患者长期服用抗凝药物预防血栓，从而达到预防脑栓塞、脑卒中目的。
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