CT扫描对于诊断脊索瘤具有一定的帮助，但是，为了完全确诊，必须依据患者的临床表现及CT、磁共振扫描，同时需要依据病理学检查，综合才能确诊。单独的CT扫描只能高度怀疑脊索瘤的可能，除非CT扫描具有典型的临床特征，比如CT扫描可以出现境界清楚的软组织影，伴广泛的骨质破坏，可以高度考虑是脊索瘤，因为脊索瘤CT扫描的典型特点就是境界清楚的软组织影，伴广泛的骨质破坏。但是，还需要依据患者是否有长期头痛，并伴有多种脑神经损害等，才能确诊。
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