由于CT扫描速度快，故对于眼部外伤或眼部肿瘤，CT检查都是首选影像学检查方法之一。尤其对于眼部外伤病变，CT可以很好观察眼部外伤之后晶状体脱离、眼眶骨折，或视神经管骨裂。此外，也可以利用CT检查观察眼球异物，比如金属异物等。但对于玻璃、木屑等异物，CT通常无法进行观察，因为其密度与软组织密度相近，CT通常并不能很好的观察。
对于眼眶或者眼球炎症，CT和磁共振检查都可以作为影像学检查方法之一。对于眶内肿瘤或甲状腺引起的眼部疾病，可以用磁共振检查方法进行进一步检查。
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