阴茎短小是可能影响正常的怀孕的。阴茎短小如果不能完成正常的性生活，精液无法射入女方生殖道内，疾病精液质量正常，精子不能与卵子结合，无法完成受精功能，都不会使女方怀孕。其次，阴茎短小可能存在先天性的畸形，比如克氏综合征，也可能存在原发性性腺功能减退，这些疾病常常伴有睾丸发育不良和生精功能障碍。所以很难保证有正常的精子与卵子结合，这样使女方怀孕的概率就会变得非常低。
