治疗泌尿系感染首选喹诺酮类抗生素，因为喹诺酮类抗生素高效、低毒，而且在泌尿系中的有效药物浓度非常高，所以是泌尿系感染的首选抗生素。常用的药物包括左氧氟沙星，待患者症状消失后，先不要着急停药，再复查一次尿常规，直到尿常规中白细胞恢复正常，才算真正的彻底治愈。
如果泌尿系感染的患者年龄＜18岁或者是妊娠、哺乳阶段的女性，建议不要吃喹诺酮类抗生素，因为会影响孩子的骨骼发育。如果患者没有青霉素和头孢菌素的过敏史，建议吃头孢类的抗生素，常用的药物包括头孢克洛。
在治疗期间鼓励患者要多喝水、少吃辛辣食物，针对膀胱刺激症状重的患者，可以参照中医关于解热通淋的治法，加用癃清片、金钱草颗粒等中成药，帮助患者更快缓解症状。
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