乙肝的急性发作主要通过口服的药物进行抗病毒治疗，如果出现严重的转氨酶异常或者胆红素升高，可以静脉保肝治疗，推荐的保肝药物包括阿托莫兰、思美泰以及甘草酸类的药物。有些乙肝患者会注射干扰素治疗，但干扰素可能会引起骨髓的抑制、甲状腺功能的减退以及肝功能的异常，所以目前不是乙肝抗病毒治疗一线推荐的药物。乙肝肝炎发作的急性期，需要口服恩替卡韦或替诺福韦来控制乙肝病毒的复制，并且结合积极的保肝治疗，肝功能就会逐步好转。但乙肝抗病毒治疗的疗程不定，大部分患者可能需要终身吃药。
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