脑干内有呼吸、循环的中枢存在，同时有第3-12对脑神经核以及上行、下行的神经纤维传导束。脑干病变的最大特征是交叉性瘫痪，即病灶同侧损伤平面脑神经瘫痪，对侧损伤平面以下中枢性肢体瘫痪。这是由于病变累、同侧的脑神经运动核及其纤维，以及未交叉的椎体束所致。脑干被盖部病变以脑神经瘫痪明显，脑干基底部病变则以肢体瘫痪明显，瘫痪的肢体可伴有感觉障碍。
脑干体积比较狭小、组织致密，病变有时损害两侧或引起一侧而蔓延至对侧，故临床上病人有时表现为双侧神经和双侧肢体均有症状。引起交叉性瘫痪的病变有脑干肿瘤、脑干性脑炎、脑桥出血和脑干梗死。
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