凌晨1-3点咳嗽的处理方法如下：
第一、排除是否与体位有关，如果是由于体位，必要的时候可以半卧位，减少胃肠道反流，误入呼吸道导致的咳嗽。
第二、排除是否是心脏疾病，在平卧位，回心血量增加，导致肺静脉压增高导致的咳嗽，必要的时候在医生指导下，要采取强心、利尿、扩血管的方法。
第三、考虑是否有夜间迷走神经兴奋导致的咳嗽，必要的时候可以口服复方甘草口服液，缓解夜间凌晨1-3点钟的咳嗽。
第四、分析判断是否有急性支气管的炎症或者慢性支气管炎症导致的咳嗽，必要的时候在医生指导下抗感染治疗。
第五、考虑是否有过敏的因素，尤其是睡觉的房间里有导致呼吸道过敏的物质或者因素去除。
总而言之，先要找原因，去除原因，适当采取止咳、化痰、解痉、平喘的药物治疗，大多数患者都可以得到明显的缓解。
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