不同类型的肺结核患者治疗所需的时间并不一样，有的患者在治疗过程中还需要根据病情变化调整用药方案。一般来说初治患者的标准化治疗方案通常六个月，分为两个阶段，即两个月的强化期和四个月的巩固期治疗，如新近涂片转阳的肺结核患者，治疗到两个月末痰菌检查仍为阳性，应延长一个月的强化期治疗。
继续期化疗方案不变，复治患者的治疗方案通常为八个月，也分为两个阶段，强化治疗三个月加巩固治疗五个月。对于耐药结核，世界卫生组织目前推行的孟加拉短程疗法，总疗程为9-12个月，为4-6个月的强化治疗阶段，接下来为五个月的巩固治疗阶段，但该短程方案仅适用于对喹诺酮及二线注射类药物敏感的患者，对于组成药物不敏感的人群，仍然采用至少20个月的长程疗法。
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