碘伏是一种消毒剂，如果不小心进入眼内，过高浓度的碘伏对角膜、结膜可能有较强刺激性，可能导致角膜上皮剥脱、刺激结膜使眼睛出现不适症状。建议使用生理盐水冲洗，稀释碘伏浓度，尽可能将碘伏冲出，减少碘伏与结膜、角膜的接触时间。
既往使用稀释的碘伏进行结膜囊消毒，因此并非碘伏入眼一定会造成严重后果。现在常用聚维酮碘进行结膜囊消毒，聚维酮碘属于可能达到杀菌效果的消毒剂，可以使结膜囊成为无菌状态。生理情况下结膜囊带菌，为进行手术需要处理成无菌状态，所以需要进行消毒。无论碘伏，还是聚维酮碘，对结膜、对角膜都有一定刺激性，所以要选择合适浓度的消毒剂，尽可能保护角膜、结膜，达到消毒作用。
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