如果是由于疾病治疗的需要，益生菌和鱼肝油可以一起使用。鱼肝油通常是从鲨鱼、鳕鱼等鱼类的肝脏中提炼出的脂肪类成分，含有的主要有效成分是维生素A和维生素D，鱼肝油主要用于预防和治疗维生素A和维生素D的缺乏症，如佝偻病、夜盲症、小儿手足搐搦症等。而益生菌作为活菌制剂，主要用于补充和调节人体的肠道菌群。
这两类药在使用过程中都要关注注意事项，比如益生菌作为活菌制剂，在储存过程中要避免高温，服用的过程中也要避免使用过热水冲服，一般要求用40℃以下的温水或温牛奶送服。而鱼肝油在用药过程中也要注意避免长期过量地服用，因为含有维生素A和维生素D，长期过量服用可能导致慢性中毒的症状，包括骨关节疼痛、皮肤瘙痒、口唇干裂、发热体积头痛、呕吐、便秘等一系列的症状，所以此药需按照推荐的剂量服用。
