因为存在不同的目的，选择检查孕酮时间也有所不同，但并不需要空腹。如果检测女性是否排卵，通常选择在排卵期以后进行，如果孕酮＞5ng/ml，可以证明有排卵。
更多的情况下是在怀孕时段检测孕酮，明确孕酮是否达到正常值。因为孕酮是维持正常妊娠的重要激素，这时往往会选择连续动态测定孕酮。由于人体的孕酮水平在一天会有波动，或高或低，正常值范围很大，所以为了解孕期孕酮上升是否正常，因此会选择在几天内相同时段检测。
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